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“Muy ilusionado de estar con Fernando “El Tano” Ortiz, con quien tuve varias conversaciones en las últimas semanas, platicando de lo que vemos y de lo que podemos construir junto con ustedes (afición) hacia el futuro”. Comentó Alejandro Irarragorri.
Para la afición significa el regreso de un histórico, pues Ortiz visitó la playera de los Guerreros del Torneo Clausura 2007 al Apertura 2008. Su actuación fue clave para que Santos mantuviera la categoría en el Torneo Clausura 2007 y, posteriormente, lograra el tercer campeonato en la historia del Club, en el Clausura 2008.
Respecto a su llegada al equipo con el que fue campeón, el "Tano" comentó, “Estoy muy feliz, contento e ilusionado...Voy a trabajar las 24 horas para que se vea un Santos competitivo, y que nos enorgullezca a todos el ir a la cancha a ver a ese equipo que tanto queremos. Mi compromiso es al cien, al igual que el de mi Cuerpo Técnico; no tengo dudas de que vamos a sacar a nuestro querido Club de la situación que atraviesa. Estoy feliz e invito a toda la afición a que nos acompañe al Estadio Corona"
Regresó a México en el 2022 para dirigir la categoría sub-20 del Club América. En marzo de ese mismo año fue nombrado técnico interino del primer equipo tras la destitución de Santiago Solari. Al final del torneo Clausura 2022 fue ratificado en su cargo.
Luego de dos torneos al frente de las Águilas, presentó su renuncia después de haber sido eliminados por el acérrimo rival, las Chivas, en las semifinales del Clausura 2023. Una salida muy polémica, pues se dice que, mientras seguía dirigiendo a los Azulcremas, ya tenía pactada su llegada a Monterrey junto con todo su cuerpo técnico, por lo que no es bien recordado por la afición americanista.
A días de haber dejado al América, fue anunciado como entrenador de los Rayados de Monterrey. Había firmado un contrato por 2 años, sin embargo, tan solo 15 meses después, la directiva decidió darle las gracias y fue cesado de su cargo debido a que el equipo mostró un mal desempeño en la Leagues Cup, de la que fueron eliminados en fase de grupos.